Múzeum otvorené v roku 1989 a prestavané v roku 2008 predstavuje výstavy "Jazdecký tábor v Carnuntume" a "Staroveký vodný svet Carnunta". V suteréne múzea sa nachádza skutočná rarita: krížová stavba. Hlavný kanalizačný kanál, ktorý v rozpore so všetkými starovekými stavebnými predpismi križuje potrubie s pitnou vodou z jazdeckého tábora. V záhrade sa nachádza aj lapidárium s dvanástimi náhrobnými kameňmi z pohrebiska v okolí pomocnej pevnosti. Životopisy bývalých obyvateľov, vytesané do kameňa, poskytujú osobný pohľad do ich súkromného života.
